La sécurité du Tunnel du Fréjus est depuis toujours une préoccupation permanente des sociétés concessionnaires. Dans ce but, 55 millions d’euros ont été investisdepuis 2000 afin d’améliorer la sécurité de l’ouvrage. Au niveau de l’organisation des équipes dédiées à la sécurité, ce sont au total plus de 100 personnes pour les deux sociétés, qui, à ce jour, prennent en charge la gestion du trafic et la sécurité incendie au Tunnel du Fréjus. Ces équipes sont dotées d’un matériel d’intervention spécifique.
L’ouvrage est surveillé 24 heures sur 24 par 220 caméras reliées directement au Poste de Contrôle Centralisé (PCC) qui assure une veille en temps réel permanente. Enfin, l’organisation binationalede l’ensemble des secours en cas de sinistre est définie dans le Plan de Secours Binational (PSB).